一项新的研究表明,以前未被描述的有助于消化植物纤维素的人类肠道菌在都市社会中很少见,但它们在古人和狩猎采集者体内的微生物组中却含量丰富。这些发现就那些居住于人类肠道中的能产生纤维素体的细菌以及它们对现代都市饮食和生活方式的反应提供了线索。与所有哺乳动物一样,人类须依靠肠道微生物群来消化纤维素,后者是植物纤维中的主要成分,也是植物性饮食中的常见要素。通过产生纤维素体的细菌对膳食纤维的发酵,这些难以消化的化合物被转化为短链脂肪酸,后者会对宿主健康有促进作用,其中包括预防结肠癌及调节血糖。膳食纤维对维持肠道微生物组的稳定与丰富也有助益。然而,以加工食品为主的现代工业化饮食严重缺乏植物纤维,并且纤维素在人类肠道中降解和发酵的证据也颇为稀缺。关于人类肠道中的可降解纤维素的细菌及其因应宿主生活方式和饮食的适应性改变等基本问题仍不清楚。Sarah Moraïs 和同事在组装的、含有 9 万 2143 个人类宏基因组的基因组中搜寻了关键性的纤维素体基因;他们发现了存在于人类肠道中的三种独特的、先前未描述过的、可产生纤维素体的瘤胃球菌(ruminococcal bacteria),即 Ruminococcus hominiciens、 R. primaciens 及 R. ruminiciens。演化分析表明,这些细菌可能起源于反刍动物的肠道,它们可通过获取其他微生物的基因而演化以适应人类肠道。这些细菌种类在人群中的普遍性也表现出明显差异。根据 Moraïs 等人披露,总的来说,这些菌株在古人、狩猎采集者及农村人群的体内含量丰富且广泛分布,但在工业化社会的人群中则极为罕见。这些发现表明,这些菌株正在从工业化国家人群的肠道中消失,这可能是它们对饮食和生活方式改变做出的反应;这或可解释为什么人类肠道中的纤维素发酵证据如此稀缺。
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